Die Ninja sind noch in den Minen des Königreichs Shintaro auf den Spuren des Totenkopfmagiers. Kai und Zane wurden von den anderen getrennt und landen beim Volk der Geckles, die ein großes Misstrauen den Neuankömmlingen gegenüber zeigen. Um Prinzessin Vania ist unterdessen in großer Sorge um Cole und die Ninja und folgt ihnen in die Minen. Werden unsere Helden wieder zusammenfinden?